化学消毒剂广泛用于食用菌生产中的消毒灭菌。主要类型有：

重金属盐所有重金属盐对微生物、人和动物都是有毒的，如汞、银、铝、锌、铜等。所以使用时要特别注意。常用0.1% ~ 0.2%的氯化汞溶液对玻璃器皿、非金属器械、菌种分离用的种菇、菇木表面进行消毒。

常用的氧化剂有高锰酸钾、过氧化氢、臭氧、过氧乙酸、漂白粉等。用0.1% ~ 0.2%的高锰酸钾溶液作用10 ~ 30分钟可杀灭微生物营养成分，2% ~ 3%的高锰酸钾溶液短时间作用可导致细菌和孢子死亡。高锰酸钾水溶液遇空气易分解，应配合使用。

还原剂甲醛是一种常用的还原性消毒剂，市售福尔马林是含37% ~ 40%的甲醛溶液。5%福尔马林可杀灭细菌孢子和真菌孢子。

表面活性剂

乙醇：70% ~ 75%的酒精消毒力最强。过高或过低消毒效果差。常用于接种前的手指消毒和不耐热产品的消毒。

碳酸：一般用5%的水溶液作为消毒剂。需要先用热水融化。

(3)来苏儿(煤酚皂溶液):为棕色粘稠液体，甲酚含量为48% ~ 52%，易溶于水，杀菌力是石炭酸的4倍。

(4)新洁尔灭：为淡黄色胶体，有香味，易溶于水，具有表面活性，消毒特点迅速、彻底、高效。

其他消毒剂

石灰：石灰可分为生石灰和熟石灰。四份生石灰加一份水，即熟石灰，放出热量，有杀菌作用。

硫磺：硫磺常用于培养室、菇房等空间的熏蒸消毒。

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